Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MR1Q95460 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MR1Q95460 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MR1Q95460 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MR1Q95460 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MR1Q95460 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MR1Q95460 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MR1Q95460 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MR1Q95460 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MR1Q95460 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MR1Q95460 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MR1Q95460 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MR1Q95460 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MR1Q95460 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MR1Q95460 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MR1Q95460 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MR1Q95460 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MR1Q95460 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MR1Q95460 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MR1Q95460 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MR1Q95460 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MR1Q95460 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MR1Q95460 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MR1Q95460 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MR1Q95460 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MR1Q95460 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MR1Q95460 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MR1Q95460 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MR1Q95460 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MR1Q95460 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MR1Q95460 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MR1Q95460 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MR1Q95460 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MR1Q95460 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MR1Q95460 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MR1Q95460 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MR1Q95460 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MR1Q95460 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MR1Q95460 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MR1Q95460 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MR1Q95460 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MR1Q95460 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MR1Q95460 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MR1Q95460 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MR1Q95460 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MR1Q95460 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MR1Q95460 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MR1Q95460 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MR1Q95460 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MR1Q95460 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MR1Q95460 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MR1Q95460 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MR1Q95460 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MR1Q95460 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MR1Q95460 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MR1Q95460 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MR1Q95460 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MR1Q95460 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MR1Q95460 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MR1Q95460 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MR1Q95460 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MR1Q95460 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MR1Q95460 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MR1Q95460 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MR1Q95460 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MR1Q95460 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MR1Q95460 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MR1Q95460 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MR1Q95460 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MR1Q95460 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MR1Q95460 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MR1Q95460 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MR1Q95460 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MR1Q95460 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MR1Q95460 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MR1Q95460 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MR1Q95460 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MR1Q95460 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MR1Q95460 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MR1Q95460 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MR1Q95460 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MR1Q95460 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MR1Q95460 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MR1Q95460 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MR1Q95460 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MR1Q95460 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MR1Q95460 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MR1Q95460 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MR1Q95460 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms