Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP7Q93009 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP7Q93009 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP7Q93009 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP7Q93009 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP7Q93009 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP7Q93009 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP7Q93009 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP7Q93009 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP7Q93009 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP7Q93009 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP7Q93009 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP7Q93009 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP7Q93009 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP7Q93009 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP7Q93009 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP7Q93009 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP7Q93009 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP7Q93009 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP7Q93009 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP7Q93009 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP7Q93009 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP7Q93009 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP7Q93009 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP7Q93009 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP7Q93009 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP7Q93009 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP7Q93009 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP7Q93009 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP7Q93009 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP7Q93009 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP7Q93009 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP7Q93009 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP7Q93009 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP7Q93009 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP7Q93009 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP7Q93009 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP7Q93009 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP7Q93009 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP7Q93009 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP7Q93009 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP7Q93009 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP7Q93009 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP7Q93009 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP7Q93009 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP7Q93009 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP7Q93009 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP7Q93009 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP7Q93009 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP7Q93009 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP7Q93009 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP7Q93009 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP7Q93009 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP7Q93009 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP7Q93009 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP7Q93009 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP7Q93009 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP7Q93009 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP7Q93009 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP7Q93009 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP7Q93009 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP7Q93009 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP7Q93009 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP7Q93009 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP7Q93009 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP7Q93009 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP7Q93009 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP7Q93009 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP7Q93009 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP7Q93009 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP7Q93009 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP7Q93009 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP7Q93009 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP7Q93009 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP7Q93009 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP7Q93009 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP7Q93009 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP7Q93009 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP7Q93009 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP7Q93009 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP7Q93009 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP7Q93009 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP7Q93009 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP7Q93009 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP7Q93009 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP7Q93009 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP7Q93009 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP7Q93009 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP7Q93009 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP7Q93009 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP7Q93009 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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