Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RAD50Q92878 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD50Q92878 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD50Q92878 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RAD50Q92878 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAD50Q92878 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms