Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNRQ92752 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNRQ92752 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNRQ92752 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TNRQ92752 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TNRQ92752 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TNRQ92752 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
TNRQ92752 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
TNRQ92752 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TNRQ92752 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TNRQ92752 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TNRQ92752 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TNRQ92752 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TNRQ92752 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TNRQ92752 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
TNRQ92752 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
TNRQ92752 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TNRQ92752 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TNRQ92752 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TNRQ92752 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNRQ92752 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNRQ92752 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TNRQ92752 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TNRQ92752 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TNRQ92752 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TNRQ92752 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
TNRQ92752 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TNRQ92752 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TNRQ92752 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TNRQ92752 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TNRQ92752 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TNRQ92752 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
TNRQ92752 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TNRQ92752 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TNRQ92752 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNRQ92752 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNRQ92752 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
TNRQ92752 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNRQ92752 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TNRQ92752 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNRQ92752 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TNRQ92752 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNRQ92752 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TNRQ92752 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
TNRQ92752 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNRQ92752 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNRQ92752 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNRQ92752 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNRQ92752 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TNRQ92752 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
TNRQ92752 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TNRQ92752 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNRQ92752 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNRQ92752 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TNRQ92752 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TNRQ92752 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TNRQ92752 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
TNRQ92752 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TNRQ92752 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TNRQ92752 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TNRQ92752 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TNRQ92752 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TNRQ92752 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TNRQ92752 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TNRQ92752 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TNRQ92752 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TNRQ92752 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TNRQ92752 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TNRQ92752 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TNRQ92752 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TNRQ92752 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TNRQ92752 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNRQ92752 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNRQ92752 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNRQ92752 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TNRQ92752 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TNRQ92752 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TNRQ92752 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TNRQ92752 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNRQ92752 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNRQ92752 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TNRQ92752 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TNRQ92752 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TNRQ92752 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNRQ92752 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TNRQ92752 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNRQ92752 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TNRQ92752 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNRQ92752 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNRQ92752 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNRQ92752 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNRQ92752 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TNRQ92752 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TNRQ92752 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TNRQ92752 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TNRQ92752 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TNRQ92752 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TNRQ92752 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TNRQ92752 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TNRQ92752 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms