Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMPDL3BQ92485 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPDL3BQ92485 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPDL3BQ92485 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms