Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2Q8WWK9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CKAP2Q8WWK9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP2Q8WWK9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP2Q8WWK9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP2Q8WWK9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP2Q8WWK9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP2Q8WWK9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CKAP2Q8WWK9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP2Q8WWK9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP2Q8WWK9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP2Q8WWK9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms