Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
WHAMMQ8TF30 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WHAMMQ8TF30 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WHAMMQ8TF30 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WHAMMQ8TF30 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WHAMMQ8TF30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WHAMMQ8TF30 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.55■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.52■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.51■■■□□ 2
WHAMMQ8TF30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WHAMMQ8TF30 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WHAMMQ8TF30 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms