Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE12

LMX1A, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMX1AQ8TE12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMX1AQ8TE12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMX1AQ8TE12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMX1AQ8TE12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMX1AQ8TE12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMX1AQ8TE12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms