Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TMC1Q8TDI8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TMC1Q8TDI8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.63■■■■□ 3.3
TMC1Q8TDI8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TMC1Q8TDI8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TMC1Q8TDI8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
TMC1Q8TDI8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TMC1Q8TDI8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TMC1Q8TDI8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TMC1Q8TDI8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms