Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
DDX54Q8TDD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
DDX54Q8TDD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
DDX54Q8TDD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DDX54Q8TDD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DDX54Q8TDD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDX54Q8TDD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
DDX54Q8TDD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
DDX54Q8TDD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DDX54Q8TDD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DDX54Q8TDD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.81■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
DDX54Q8TDD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DDX54Q8TDD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms