Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRSK1Q8TDC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRSK1Q8TDC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK1Q8TDC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms