Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOXF1Q8NHV9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOXF1Q8NHV9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOXF1Q8NHV9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms