Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA1Q8NG27 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PJA1Q8NG27 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PJA1Q8NG27 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA1Q8NG27 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms