Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6DQ8NFY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6DQ8NFY4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6DQ8NFY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms