Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT1Q8NF37 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT1Q8NF37 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LPCAT1Q8NF37 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPCAT1Q8NF37 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LPCAT1Q8NF37 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPCAT1Q8NF37 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPCAT1Q8NF37 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPCAT1Q8NF37 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT1Q8NF37 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms