Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIPK4Q8NE63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIPK4Q8NE63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HIPK4Q8NE63 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIPK4Q8NE63 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms