Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNRF1Q8ND25 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF1Q8ND25 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF1Q8ND25 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNRF1Q8ND25 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF1Q8ND25 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF1Q8ND25 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms