Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MFSD2AQ8NA29 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MFSD2AQ8NA29 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MFSD2AQ8NA29 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms