Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNTD1Q8N815 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTD1Q8N815 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTD1Q8N815 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTD1Q8N815 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTD1Q8N815 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms