Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME8Q8N427 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NME8Q8N427 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME8Q8N427 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME8Q8N427 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME8Q8N427 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NME8Q8N427 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME8Q8N427 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME8Q8N427 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME8Q8N427 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME8Q8N427 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME8Q8N427 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
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