Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LTBP4Q8N2S1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LTBP4Q8N2S1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LTBP4Q8N2S1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LTBP4Q8N2S1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LTBP4Q8N2S1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LTBP4Q8N2S1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
LTBP4Q8N2S1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
LTBP4Q8N2S1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LTBP4Q8N2S1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LTBP4Q8N2S1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
LTBP4Q8N2S1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms