Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2J2Q8N2K1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2J2Q8N2K1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2J2Q8N2K1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms