Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI4Q8N135 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LGI4Q8N135 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGI4Q8N135 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms