Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLGN4XQ8N0W4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLGN4XQ8N0W4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLGN4XQ8N0W4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms