Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00518Q8N0U6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00518Q8N0U6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00518Q8N0U6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms