Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT20Q8IY31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IFT20Q8IY31 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT20Q8IY31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT20Q8IY31 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFT20Q8IY31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms