Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLD3Q8IV08 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD3Q8IV08 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLD3Q8IV08 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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PLD3Q8IV08 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD3Q8IV08 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD3Q8IV08 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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