Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB43Q86YS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB43Q86YS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB43Q86YS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB43Q86YS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB43Q86YS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB43Q86YS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB43Q86YS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB43Q86YS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB43Q86YS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB43Q86YS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB43Q86YS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB43Q86YS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms