Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NME9Q86XW9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NME9Q86XW9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NME9Q86XW9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NME9Q86XW9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NME9Q86XW9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NME9Q86XW9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NME9Q86XW9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
NME9Q86XW9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NME9Q86XW9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NME9Q86XW9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NME9Q86XW9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NME9Q86XW9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms