Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC84Q86UT8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC84Q86UT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC84Q86UT8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC84Q86UT8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms