Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PBRM1Q86U86 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
PBRM1Q86U86 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
PBRM1Q86U86 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
PBRM1Q86U86 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
PBRM1Q86U86 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
PBRM1Q86U86 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PBRM1Q86U86 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
PBRM1Q86U86 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
PBRM1Q86U86 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PBRM1Q86U86 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
PBRM1Q86U86 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
PBRM1Q86U86 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
PBRM1Q86U86 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PBRM1Q86U86 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms