Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP54Q7Z3B4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP54Q7Z3B4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP54Q7Z3B4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP54Q7Z3B4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms