Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2Z1

TICRR, Treslin, humanhuman

Predictions only

Length 1,910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TICRRQ7Z2Z1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TICRRQ7Z2Z1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TICRRQ7Z2Z1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TICRRQ7Z2Z1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.8
TICRRQ7Z2Z1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TICRRQ7Z2Z1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TICRRQ7Z2Z1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms