Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP9Q7RTR0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP9Q7RTR0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP9Q7RTR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRP9Q7RTR0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms