Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC8DQ7L1W4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC8DQ7L1W4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC8DQ7L1W4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC8DQ7L1W4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC8DQ7L1W4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC8DQ7L1W4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms