Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q7L0L9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q7L0L9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q7L0L9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q7L0L9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q7L0L9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q7L0L9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q7L0L9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q7L0L9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Q7L0L9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q7L0L9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Q7L0L9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Q7L0L9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q7L0L9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q7L0L9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q7L0L9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q7L0L9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q7L0L9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q7L0L9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Q7L0L9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q7L0L9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q7L0L9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q7L0L9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q7L0L9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q7L0L9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Q7L0L9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q7L0L9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q7L0L9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q7L0L9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q7L0L9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q7L0L9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q7L0L9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q7L0L9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Q7L0L9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Q7L0L9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q7L0L9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q7L0L9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q7L0L9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q7L0L9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q7L0L9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q7L0L9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q7L0L9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q7L0L9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q7L0L9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q7L0L9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q7L0L9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q7L0L9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q7L0L9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q7L0L9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q7L0L9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q7L0L9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q7L0L9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Q7L0L9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q7L0L9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q7L0L9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q7L0L9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Q7L0L9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Q7L0L9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q7L0L9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q7L0L9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q7L0L9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q7L0L9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Q7L0L9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q7L0L9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q7L0L9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q7L0L9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q7L0L9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q7L0L9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q7L0L9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q7L0L9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q7L0L9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q7L0L9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Q7L0L9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q7L0L9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q7L0L9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q7L0L9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q7L0L9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q7L0L9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q7L0L9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q7L0L9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q7L0L9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q7L0L9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Q7L0L9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q7L0L9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q7L0L9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q7L0L9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q7L0L9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Q7L0L9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q7L0L9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q7L0L9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q7L0L9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Q7L0L9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q7L0L9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Q7L0L9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q7L0L9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q7L0L9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q7L0L9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q7L0L9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q7L0L9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Q7L0L9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms