Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTU2

EP400NL, EP400 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400NLQ6ZTU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EP400NLQ6ZTU2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
EP400NLQ6ZTU2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EP400NLQ6ZTU2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400NLQ6ZTU2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400NLQ6ZTU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms