Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP47Q6ZTR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP47Q6ZTR5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP47Q6ZTR5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP47Q6ZTR5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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