Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM44Q6ZP01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM44Q6ZP01 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBM44Q6ZP01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM44Q6ZP01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms