Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF111Q6ZNA4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF111Q6ZNA4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF111Q6ZNA4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF111Q6ZNA4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms