Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP12Q6UXS9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP12Q6UXS9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP12Q6UXS9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP12Q6UXS9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms