Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms