Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOA5Q6Q788 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
APOA5Q6Q788 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOA5Q6Q788 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
APOA5Q6Q788 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOA5Q6Q788 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APOA5Q6Q788 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APOA5Q6Q788 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms