Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM88Q6PEY1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM88Q6PEY1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM88Q6PEY1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms