Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
EDC4Q6P2E9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
EDC4Q6P2E9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
EDC4Q6P2E9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
EDC4Q6P2E9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
EDC4Q6P2E9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
EDC4Q6P2E9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
EDC4Q6P2E9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
EDC4Q6P2E9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EDC4Q6P2E9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
EDC4Q6P2E9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms