Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DENND4CQ5VZ89 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DENND4CQ5VZ89 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND4CQ5VZ89 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms