Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GKAP1Q5VSY0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GKAP1Q5VSY0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GKAP1Q5VSY0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GKAP1Q5VSY0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GKAP1Q5VSY0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms