Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCCQ5TZA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCQ5TZA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCCQ5TZA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms