Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SAMD9Q5K651 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SAMD9Q5K651 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
SAMD9Q5K651 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SAMD9Q5K651 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SAMD9Q5K651 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SAMD9Q5K651 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms