Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPIN3Q5JUX0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIN3Q5JUX0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIN3Q5JUX0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIN3Q5JUX0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms